由于有機棉對肥料、殺蟲劑要求較高，且易受病蟲害影響。加之烏東部地區棉農在經歷上一季節有機棉低產量損失后，目前烏東部帕里薩（Paliisa）、斯羅可（Sironko）和布達卡（Budaka）地區棉農已放棄種植有機棉而改種普通棉。
　　
    此外，在烏經營有機棉的跨國公司和其他有機棉發起組織，未按承諾向烏棉農提供高收購價格，致使棉農積極性受挫，也是造成烏東部地區棉農改種普通棉的重要原因。
　　
    烏東部地區一棉農表示，種植普通棉僅使用普通合成肥和殺蟲劑就能達到高產。而種植有機棉不僅成本高，產量低，損失大，并且政府也不能提供免費高產有機棉種子、殺蟲劑和推廣服務。為此，烏東部產棉區大部分棉農已恢復種植普通棉。烏有機棉種植面臨危機。